Основной задачей института является оказание высококвалифицированной и высокотехнологичной специализированной медицинской помощи при заболеваниях уха, глотки, гортани, полости носа и околоносовых пазух и при патологии речи.

В НИИ ЛОР осуществляют комплексное диагностическое обследование, включающее осмотр специалистов, эндоскопию ЛОР-органов, обследование при помощи микроскопов уха, стробоскопическое исследование голосовых связок, тональную и пороговую аудиометрию, импедансометрию, компьютерную риноманометрию и томографию, лабораторную диагностику, включающую аллерготесты, иммунологические, микробиологические, биохимические и клинические исследования.

Институт обладает опытным штатом клиницистов и научных работников, включающим 19 докторов медицинских наук и 45 кандидатов медицинских наук по специальности, осуществляющих научные исследования во всех областях оториноларингологии.

Институт обладает довольно большим специализированным коечным фондом - 205 больничных коек. В состав института входят отделения патологии верхних дыхательных путей, отделения реконструктивной хирургии уха, детское отоларингологическое отделение, детское и взрослое отделения патологии речи. Кроме этого функционирует поликлиническое отделение, отделение фониатрии, отделение сурдологии, ведут специализированный прием аллерголог, терапевт, окулист, невропатолог, педиатр, психолог и ряд других специалистов. Институт имеет собственные клинические лаборатории, лаборатории морфологии, биохимии, иммунологии. Рентгенологическое отделение обладает самым совершенным оборудованием, включая единственный в городе специализированный компьютерный томограф "голова-шея". Имеется также весь комплекс физиотерапевтического оборудования. Отделения института оснащены новейшим высокотехнологичным оборудованием как лечебно диагностическим, так и хирургическим: операционные микроскопы, эндоскопическая аппаратура, лазерные установки.