Ученые из Cambridge University и European Bioinformatics Institute нашли способ предсказывать рак по ДНК-тесту клеток из кардиоэзофагеальной зоны при пищеводе Баррета.
При пищеводе Баррета в области соединения пищевода с желудком, которая называется кардиоэзофагеальной зоной, появляются аномальные клетки: вместо естественного для этого участка плоского эпителия появляется метапластический цилиндрический эпителий. У одного из 300 человек с пищеводом Баррета в этой области развивается раковая опухоль. В то же время, если клетки не имеют тенденции к озлокачествлению, то лечение не требуется, а регулярная биопсия не увеличивает человеку здоровье.
Ученые секвенировали («прочитали») ДНК 88 пациентов с пищеводом Баррета и сравнили данные с результатами сиквенса 777 образцов, полученных у здоровых людей. Таким образом они идентифицировали фрагменты генома, которые были удалены или, наоборот, повторялись несколько раз.
По полученным данным была построена статистическая модель. На протяжении нескольких лет ученые наблюдали за 76 пациентами и обнаружили, что при помощи этой модели им удалось точно предсказать развитие рака у 2/3 пациентов в течение двух лет и у половины испытуемых в течение 8 лет. В группу высокого риска развития рака попали люди, чья ДНК имела многочисленные повторы и иные сложные изменения, доля которых со временем постоянно увеличивалась.
Это значит, что пациентов из группы повышенного риска можно начинать лечить сразу, не дожидаясь обострения болезни и не делая регулярную биопсию, пока не появятся первые признаки рака.
