Ученые из Medicine at Harvard Medical School предложили создать универсальную вакцину против COVID-19 на основе немутирующих участков вируса.
Исследователи планируют использовать для создания принципиально новой Т-клеточной вакцины результаты их экспериментов с ВИЧ – одним из самых быстро мутирующих РНК-вирусов, известных человечеству. При помощи метода структурного анализа сетей ученые определяют, какие вирусные участки не мутируют вовсе или мутируют крайне редко. Такие участки получили название мутационно ограниченных эпитопов. Изменения в них фатальны для вируса: он теряет способность реплицироваться (размножаться) или заражать другие клетки.
Используя тот же метод, исследователи определили 311 мутационно ограниченных эпитопов для коронавируса SARS-CoV-2, которые при этом могут распознаваться CD8+ Т-лимфоцитами. Из этих 311 были выделены 53 эпитопа, которые предлагается использовать для создания вакцины для «тренировки» Т-клеток, обеспечивая Т-клеточный защитный иммунитет.
«Представьте себе структуру вируса как архитектуру здания. Его устойчивость зависит от нескольких жизненно важных элементов – опорных балок и фундамента, которые поддерживают остальные детали конструкции. Можно менять форму и размер дверей и окон, не подвергая опасности разрушения весь дом. Но изменения в конструктивных элементах будут опасны для его существования. Вот такими элементами и являются мутационно ограниченные эпитопы», объясняют ученые.
Обследование пациентов, выздоровевших от COVID-19, показала, что у половины из них имеются Т-клеточные ответы на тем самые мутационно ограниченные эпитопы, о которых идет речь. Это подтверждает предположение ученых о возможности использовать их для создания вакцин, работающих против всех вариантов пандемического коронавируса.