Новый метод расчета белкового взаимодействия ускорит разработку лекарств

Биологи и математики из МФТИ, университета Стони Брук и других научно-исследовательских центров научили компьютер в 10 раз быстрее предсказывать строение «сцеплений» белков в клетке. Работа опубликована в журнале PNAS.

Чтобы из возможных вариантов расположения двух больших молекул относительно друг друга получить такую, которая существует в реальном мире, ученые решают следующую задачу: даны два белка с известной структурой. Необходимо предсказать, как будет выглядеть их «стыковка».

В научной терминологии такая задача называется «белок-белковый докинг». Вычислительную сложность такой операции можно сравнить с составлением всех возможных вариантов из 10 тыс. начальных блоков конструктора. Идея исследователей состояла в том, чтобы представить белки как сочетание «квантовых поверхностей» — некоторых блоков, описываемых математическим аппаратом квантовой механики. Такой подход позволяет одновременно рассчитывать взаимодействие многих пар белковых участков между собой, а не оценивать каждую пару независимо. Новый метод может работать до ста раз быстрее лучших из уже существующих методов, при этом сохраняя точность.

По словам ученых, такая программа «считается» 15 минут на персональном компьютере и является серьезной альтернативой экспериментальным методикам определения белковых взаимодействий. «В обычной клетке осуществляются тысячи различных белковых взаимодействий. Объяснение этих взаимодействий помогает описывать важные процессы: работу организма в целом и методов лечения некоторых заболеваний (например, рака)», — комментирует исследование Дмитрий Козаков, профессор университета Стони Брук и адъюнкт-профессор МФТИ.

Читайте далее

Забота уровня премиум: что могут современные подгузники

Какие новые технологичные решения в создании подгузников созданы в классе премиум
Опубликовано 14.07.2016 20:33, обновлено 15.09.2017 08:11
Рейтинг статьи:
4,6

Ссылка на первоисточник:

Забота уровня премиум: что могут современные подгузники

Какие новые технологичные решения в создании подгузников созданы в классе премиум

Читайте также

В США будет создан медицинский консорциум для эффективной борьбы с наиболее тяжелыми болезнями
В рамках создания нового партнерского медицинского консорциума (Accelerating Medicines Partnership), национальные институты здравоохранения в партнерстве с учеными из 10 конкурирующих фармацевтических компаний и нескольких некоммерческих организаций США,  приступят к разработке новых методов лечения таких заболеваний, как диабет, болезнь Альцгеймера и волчанка. 
Российские ученые приступили к разработке лекарства от лейкоза
Ученые Московского государственного технического университета имени Н.Э. Баумана и НИИ СП им. Н.В. Склифосовского совместно с НПО «Микроген» приступили к разработке нового лекарственного препарата для лечения лейкоза. 
Силами университета и НИИ будет обеспечена реализация научной составляющей проекта, а «Микроген» станет техническим партнером, а затем и производителем лекарства.
Ученые из ДВФУ ищут лекарства от рака в грибах
Ученые из Владивостока занимаются разработкой лекарств из грибов для лечения нескольких распространенных видов рака.
Обнаружены белки, связанные с раком груди у мужчин
Британские ученые из Университета Лидса выявили белки, наличие которых снижает шансы на выживание у мужчин с раком молочной железы. Это дает повод для разработки лекарств специально для представителей мужского пола.
Ученые нашли связь между месяцем рождения человека и его здоровьем
Исследователи изобрели метод, позволяющий выявить склонность человека к 55 болезням. При этом основной критерий оценки - дата и месяц его рождения.
РНК коронавируса в крови говорит о риске смерти от COVID-19
РНКемия – наличие в крови РНК коронавируса SARS-CoV-2 – является маркером повышенного риска смерти пациента от COVID-19.